A Casa Transitória, em parceria com as Secretarias Municipais de Educação de São Paulo e de São José dos Campos, administra três creches para crianças de 0 até 6 anos, que funcionam de segunda a sexta-feira, no horário das 8 às 17h. Sendo atendidas por profissionais da educação com todo o carinho e cuidado necessário. Atualmente, são atendidas 361 crianças nas creches Bezerra de Menezes e Fabiano de Cristo, em São Paulo, e Meimei em São José dos Campos.